《厦门特区党校学报》办刊宗旨是:“为繁荣社会科学事业服务,为党校教学科研服务,为特区现代化建设服务。”在此宗旨指导下,强调突出刊物的学报性、学术性、党性,从党校、行政学院的特殊情况出发,面对学术界和广大党员领导干部,突出研究马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、“三个代表”和科学发展观重要思想的学术成果;突出研究党的路线、方针、政策的学术成果;突出研究经济社会发展中现实问题的学术成果.